検査SNP一覧
MYCODEでは下記のSNPを検査対象としています（2018年10月時点）
項目名 | 検査SNP（遺伝子名） |
|---|---|
胃がん | rs3781264(PLCE1) |
胃がん（噴門部胃がん） | rs2274223(PLCE1) rs10074991 |
胃がん（びまん性胃がん、未分化型胃がん） | rs2294008(PSCA) |
胃がん（非噴門部胃がん、分化型胃がん） | rs13361707(PRKAA1) rs2494938(LRFN2) |
食道がん | rs3819197(ADH1A) rs671(ALDH2) |
大腸がん | rs1321311(MIR3925 - LAP3P2) rs6983267(SRRM1P1 - POU5F1B) rs7229639(SMAD7) rs6687758(DUSP10 - QRSL1P2) rs704017 rs10795668(CHCHD3P1 - HSP90AB7P) rs1535(FADS2) rs10774214(RPL18P9 - CCND2) rs1800469 rs2423279(SRSF10P2) rs12241008 |
肝臓がん | rs1012068(DEPDC5) |
すい臓がん | rs1547374(TFF2 - TFF1) rs2255280(DAB2) rs372883(BACH1) rs5768709(FAM19A5) rs12413624(FAM204A - PRLHR) rs9573163(RNY1P8 - MARK2P12) rs3790844(NR5A2) |
肺がん（扁平上皮がん） | rs12296850(SLC17A8 - NR1H4) |
肺がん（肺腺がん） | rs10937405(TP63) rs2853677(TERT) rs7216064(BPTF) |
肺がん（非小細胞肺がん） | rs2131877(XXYLT1) |
甲状腺がん | rs944289(PTCSC3 - MBIP) rs965513(KRT18P13 - FOXE1) rs6759952(DIRC3) |
上咽頭がん | rs2860580(HLA-U - HCG4P5) rs6774494(MECOM) rs9510787(TNFRSF19) |
頭頚部がん | rs1494961(HELQ) rs4767364(NAA25) |
基底細胞がん | rs157935 rs401681(CLPTM1L) rs7538876(PADI6) rs801114(RHOU - ISCA1P2) |
悪性黒色腫 | rs16953002(FTO) rs7412746(LOC100996521) rs258322(CDK10) |
腎細胞がん | rs4765623(SCARB1) rs7105934(LOC100505834) rs7579899(EPAS1) |
膀胱がん | rs11543198 |
精巣がん | rs10275045(MAD1L1) rs10510452(RFTN1 - DAZL) rs17021463(HPGDS) rs2072499(SLC25A44) rs210138(BAK1) rs2720460(CENPE) rs2839186(MCM3AP) rs2900333(ATF7IP - PLBD1) rs3805663(PITX1) rs4624820(NDFIP1 - SPRY4) rs4657482(UCK2) rs4888262(RFWD3) rs7010162(PRDM14) rs7221274(PPM1E) rs755383(DMRT1) rs8046148(RNY4P3 - RPL10P14) rs995030(KITLG) |
前立腺がん | rs10993994(MSMB) rs1512268(FAM60DP - NKX3-1) rs339331(RFX6) rs9600079(RNU6-66 - RNU7-89P) rs7679673(RPL6P14 - TET2) rs1465618(THADAP) rs5759167(RPS25P10 - BIK) rs7127900(MIR4686 - ASCL2) rs12621278(ITGA6) rs17021918(PDLIM5) rs10875943(TUBA1C - PRPH) rs10187424(GGCX - VAMP8) rs7584330(COL6A3 - MLPH) rs6763931(ZBTB38) rs2242652(TERT) rs2121875(FGF10) rs130067(CCHCR1) rs10505483(SRRM1P1 - POU5F1B) rs10009409 |
乳がん | rs2981578(FGFR2) rs4784227(LOC643714) |
子宮頸がん | rs8067378(ZPBP2 - GSDMB) rs9277952(ZNF70P1 - HCG25) |
子宮体がん（子宮内膜がん） | rs7501939(HNF1B) rs937213 |
卵巣がん（浸潤性上皮性卵巣がん） | rs10088218(MIR1208 - MIR3686) rs1243180(MLLT10) rs2072590(HOXD-AS1) rs3814113(BNC2 - RPL31P42) |
卵巣がん（漿液性浸潤性上皮性卵巣がん） | rs10088218(MIR1208 - MIR3686) rs2072590(HOXD-AS1) rs3814113(BNC2 - RPL31P42) rs757210(HNF1B) |
ウィルムス腫瘍 | rs1027643(PCBP2P3 - LDHBP3) rs2283873(TCN2) rs3755132(DDX1) rs790356(DLG2) |
髄膜腫 | rs11012732(MLLT10) |
骨肉腫 | rs1906953(GRM4) rs7591996(SOX11 - LINC00487) |
神経芽細胞腫 | rs110419(LMO1) rs4336470(HACE1) |
ユーイング肉腫 | rs224278(EGR2) rs4924410(LOC100131089) rs9430161(CFL1P6) |
神経膠腫 | rs2736100(TERT) rs4295627(MIR3686 - GSDMC) rs4977756(CDKN2B-AS1) rs498872(PHLDB1) rs6010620(RTEL1;RTEL1-TNFRSF6B) |
多発性骨髄腫 | rs1052501(ULK4) rs10936599(MYNN) rs2285803(PSORS1C1;PSORS1C2) rs4273077(TNFRSF13B) rs4487645(DNAH11) rs877529(CBX7) |
慢性骨髄性白血病 | rs4795519(TUFMP1 - RPL34P31) |
慢性リンパ性白血病 | rs210134(BAK1) rs10936599(MYNN) rs11636802 rs1679013(CDKN2B-AS1 - DMRTA1) rs2236256(OPRM1;IPCEF1) rs2466035 rs3769825(CASP8) rs391023 rs4368253(PMAIP1 - NFE2L3P1) rs4406737(FAS) rs7176508(RPLP1 - GEMIN8P1) rs735665(MIR4493 - GRAMD1B) rs7944004(ASCL2 - TSPAN32) rs898518(LEF1) rs872071(IRF4) rs17483466(ACOXL) |
ホジキンリンパ腫 | rs1432295(PAPOLG - RPL21P33) rs2019960(MIR1208 - MIR3686) rs6903608(HLA-DRB9 - HLA-DRB5) rs1860661 rs20541(IL13) rs3806624 rs7745098 |
ホジキンリンパ腫（結節硬化型） | rs6903608(HLA-DRB9 - HLA-DRB5) rs1860661 rs20541(IL13) |
B細胞性非ホジキンリンパ腫 | rs6773854(BCL6 - LPP-AS2) |
濾胞性（ろほうせい）リンパ腫 | rs4937362(ETS1 - FLI1-AS1) rs2647012(HLA-DQB1 - MTCO3P1) rs4938573 |
B型慢性肝炎 | rs3077(HLA-DPA1) |
C型慢性肝炎 | rs9275572(MTCO3P1 - HLA-DQA2) |
HCVによる肝硬変 | rs3135363(BTNL2 - HLA-DRA ) |
原発性胆汁性肝硬変（PBC） | rs4938534(POU2AF1 - BTG4) rs4979462(TNFSF15) |
非アルコール性脂肪性肝疾患 | rs738409(PNPLA3) |
十二指腸潰瘍 | rs2294008(PSCA) rs505922(ABO) |
潰瘍性大腸炎 | rs9263739(CCHCR1) |
クローン病 | rs1487630(TBC1D1 - FLJ13197) rs6478106(C9orf91 - TNFSF15) rs7329174(ELF1) rs7765379(MTCO3P1 - HLA-DQA2) rs9891119(STAT3) |
すい炎 | rs10273639(PRSS1) |
バレット食道 | rs9257809(OR12D3 - OR12D2) rs9936833(IRF8 - FENDRR) |
好酸球性食道炎 | rs371915(KIAA1609 - COTL1) rs3806932(TSLP) rs2898261 |
原発性硬化性胆管炎 | rs3197999(MST1) |
慢性腎臓病 | rs4293393(UMOD) |
IgA腎症 | rs12537(MTMR3) rs2738048(DEFA9P - DEFA10P) rs3803800(TNFSF13;TNFSF12-TNFSF13) rs6677604(CFH) rs9275596(MTCO3P1 - HLA-DQA2) |
ネフローゼ症候群 | rs16946160(GPC5) |
尿路結石症 | rs1000597(FAM188B - AQP1) rs11746443(RGS14) rs4142110(DGKH) |
末期腎不全 | rs4821469(APOL4 - APOL2) |
IgA欠乏症 | rs1990760(IFIH1) rs9271366(HLA-DRB1 - HLA-DQA1) |
1型糖尿病 末期腎不全 | rs12437854(SEPHS1P2 - RPL26P5) rs7583877(AFF3) |
心筋梗塞 | rs11748327(IRX1 - ADAMTS16) |
心房細動 | rs2634073 |
心不全 | rs10519210(CA12 - USP3) |
冠動脈性心疾患 | rs671(ALDH2) rs944797(CDKN2B-AS1) |
拡張型心筋症 | rs2234962(BAG3) |
脳梗塞（アテローム血栓性脳梗塞） | rs556621(MIR4642 - NUDT19P4) rs12425791(NINJ2 - WNK1) |
脳梗塞（心原性脳梗塞） | rs6843082(PITX2 - MIR297) rs879324(ZFHX3) |
脳動脈瘤 | rs11661542(RPS4XP18 - UBE2CP2) rs12413409(CNNM2) rs1333040(CDKN2B-AS1) rs9298506(SEC11B - RP1) rs9315204(STARD13) |
もやもや病 | rs6565681(RNF213;LOC100294362) |
静脈血栓塞栓症 | rs1208134(CCDC181) rs4253399(F11) rs505922(ABO) rs7659024(FGA - FGG) |
高血圧 | rs13333226(UMOD) |
肺動脈性肺高血圧症 | rs2217560(RPS2P6 - CBLN2) |
腹部大動脈瘤 | rs1466535(LRP1) rs2383207(CDKN2B-AS1) rs7025486(DAB2IP) |
胸部大動脈解離 | rs1036477(FBN1) |
抗好中球細胞質抗体（ANCA）関連血管炎 | rs3117016 |
2型糖尿病 | rs515071(ANK1;MIR486) rs7172432(C2CD4A - C2CD4B) rs7612463(UBE2E2) rs2237892(KCNQ1) rs10886471(GRK5) rs7403531(RASGRP1) rs11257655(CDC123 - MIR4480) rs5215(KCNJ11) rs4275659 rs2261181 rs7178572(HMG20A) rs9936385 rs12970134(RPS3AP49 - MC4R) rs2943640(NYAP2 - MIR5702) rs1801282(PPARG) rs702634 rs9505118 rs3130501(POU5F1) rs3802177(SLC30A8) rs4812829(HNF4A) rs3786897(PEPD) rs831571(PSMD6 - PRICKLE2-AS1) rs9470794(ZFAND3) rs7041847(GLIS3) rs791595(MIR129-1 - LEP) rs1470579(IGF2BP2) rs7903146(TCF7L2) rs2383208(CDKN2B-AS1 - DMRTA1) rs1111875(HHEX - EXOC6) rs7756992(CDKAL1) |
1型糖尿病 | rs11755527(BACH2) rs12708716(CLEC16A) rs1990760(IFIH1) rs229541(C1QTNF6 - SSTR3) rs2542151(PSMG2 - PTPN2) rs3825932(CTSH) rs763361(CD226) rs947474(DKFZp667F0711) rs3024505(MAPKAPK2 - IL10) rs10509540(VN1R55P - RNLS) rs1465788(ZFP36L1) rs4788084(IL27 - NUPR1) rs7202877(CTRB2 - CTRB1) rs2290400(GSDMB) rs425105(PRKD2) rs2281808(SIRPG) rs10517086(C4orf52 - RBPJ) rs7804356(SKAP2) rs4900384(VRK1 - RPL3P4) rs1701704(SUOX - IKZF4 ) rs924043(LINC00574 - RPL12P23) rs10758593(GLIS3) rs2476601(PTPN22) rs2304256(TYK2) rs9976767(UBASH3A) rs1004446(IGF2;IGF2-AS;INS-IGF2) rs3117098(HCG23) |
バセドウ病 | rs2273017(C6orf10) |
花粉症 | rs2155219(C11orf30 - LRRC32) |
妊娠糖尿病 | rs10830962(FAT3 - MTNR1B) rs7754840(CDKAL1) |
セリアック病 | rs10806425(BACH2) rs10903122(RUNX3 - MIR4425) rs11221332(ETS1) rs11712165(ARHGAP31) rs1250552(ZMIZ1) rs12928822(MIR548H2 - RMI2) rs13003464(PUS10) rs13010713(UBE2E3 - MIR4437) rs13098911(FLT1P1 - CCR1) rs13314993(CCR4 - SEC13P1) rs1464510(LPP) rs17035378(PLEK) rs1738074(TAGAP) rs1893217(PTPN2) rs2327832(BTF3L4P3 - TNFAIP3) rs2816316(RGS21 - RGS1) rs296547(C1orf106 - KIF21B) rs3748816(MMEL1) rs4675374(ICOS) rs4819388(ICOSLG) rs802734(MRPS17P5 - PTPRK) rs917997(IL18RAP - SLC9A4) rs9792269(MIR1208 - MIR3686) rs6840978 |
脂質異常症（高トリグリセリド血症） | rs1260326(GCKR) rs964184(ZNF259) |
βサラセミアの重症度 | rs2071348(HBBP1) rs766432(BCL11A) rs9376092(HBS1L - MYB) |
重症筋無力症 | rs2476601(PTPN22) rs4958881(TNIP1) rs7750641(TCF19) |
甲状腺機能低下症 | rs2517532(MUC22 - HCG22) rs4915077(VAV3) rs925489(KRT18P13 - FOXE1) |
ウェゲナー肉芽腫 | rs26595(HMGN2P27 - SEMA6A) rs9277554(HLA-DPB1) |
シェーグレン症候群 | rs10168266(STAT4) rs9271588(HLA-DRB1 - HLA-DQA1) |
骨粗しょう症 | rs13182402(ALDH7A1) |
関節リウマチ | rs10821944(ARID5B) rs11900673(B3GNT2 - TMEM17) rs12529514(RNF182 - CD83) rs2233434(NFKBIE) rs2841277(PLD4) rs2847297(PTPN2) rs2867461(ANXA3) rs3093024(CCR6) rs3781913(PDE2A) rs657075(CSF2 - P4HA2) rs227163 rs793108(ZNF438 - SPTLC1P1) rs2671692 rs4409785(SESN3 - FGFR3P2) rs9653442(LOC150577) rs11889341 rs3087243(CTLA4) rs1893592 rs11089637 |
全身性エリテマトーデス（SLE） | rs10168266(STAT4) rs2230926(TNFAIP3) rs2254546(FAM167A - BLK) rs340630(AFF1) rs6964720(HIP1) rs9501626 |
強皮症 | rs2056626(CD247) rs6457617(HLA-DQB1 - MTCO3P1) rs7574865(STAT4) |
ベーチェット病 | rs1495965(IL23R - IL12RB2) rs1800871(IL10) rs4959053(PSORS1C1) rs7574070(STAT4) rs2617170(KLRC4;KLRC4-KLRK1) |
骨パジェット病 | rs1561570(OPTN) rs2458413(DCSTAMP) rs3018362(TNFRSF11A - RPL17P44) rs4294134(NUP205) rs484959(EPS8L3 - CSF1) rs5742915(PML) |
変形性関節症 | rs11177(GNL3;PBRM1;SNORD19) rs11842874(MCF2L) |
痛風 | rs12498742(SLC2A9) rs2231142(ABCG2) |
椎間板変性 | rs4148941(CHST3) |
強直性脊椎炎 | rs10865331(B3GNT2 - TMEM17) rs13202464 rs17095830(ANO6) rs4552569(RPL13AP14 - EDIL3) |
変形性膝関節症（変形性関節症の一種） | rs7775228(HLA-DQB1-MTCO3P1) |
脊柱側弯症 | rs6570507(GPR126) |
乾癬性関節炎 | rs13190932(TRAF3IP2;TRAF3IP2-AS1) |
デュプイトラン拘縮 | rs10809650(RPS27AP14 - SMARCA2) rs11672517(DUXA) rs16879765(EPDR1) rs2912522(LOC100505718) rs4730775(WNT2) rs611744(EIF3E) rs6519955(WNT7B - C22orf26) rs7524102(MIR4418 - ZBTB40) rs8124695(HSPE1P1 - MAFB) |
加齢黄斑変性 | rs13278062(TNFRSF10A;LOC389641) rs1713985(REST) |
角膜乱視 | rs7677751(PDGFRA) |
強度近視 | rs9318086(MIPEP) |
開放隅角緑内障 | rs1063192(CDKN2B;CDKN2B-AS1) |
閉塞隅角緑内障 | rs1015213(PCMTD1 - ST18) rs11024102(PLEKHA7) rs3753841(COL11A1) |
正常眼圧緑内障 | rs523096(CDKN2B-AS1) |
落屑緑内障 | rs4445847 |
糖尿病性網膜症 | rs12219125(PLXDC2 - AMD1P1) rs17376456(KIAA0825) rs2038823(HS6ST3) rs4838605(ARHGAP22) |
円錐角膜 | rs4954218(MAP3K19 - RAB3GAP1) |
フックス角膜内皮ジストロフィー | rs613872(TCF4) |
耳硬化症 | rs3914132(RELN) |
アルツハイマー病 | rs11218343(SORL1) rs429358(APOE) |
パーキンソン病 | rs11931074(GPRIN3 - SNCA) rs1994090(SLC2A13) rs4538475(RPL10AP7 - CD38) rs947211(RAB7L1 - SLC41A1) |
筋萎縮性側索硬化症（ALS） | rs6703183(MIR205 - CAMK1G) rs8141797(SUSD2) |
部分てんかん | rs2292096(CAMSAP2) |
全般性てんかん | rs13026414(EIF2S2P7 - VRK2) |
欠神てんかん | rs10496964(ZEB2-AS1 - SGCEP) |
ミオクロニーてんかん | rs12059546(CHRM3) |
多発性硬化症 | rs1077667(TNFSF14) rs11154801(AHI1) rs11581062(SLC30A7) rs11810217(EVI5) rs12212193(BACH2) rs12466022(FTOP1 - ZFP36L2) rs1250550(ZMIZ1) rs1323292(RGS21 - RGS1) rs1335532(CD58) rs140522(ODF3B) rs17174870(MERTK) rs1738074(TAGAP) rs17445836(IRF8 - FENDRR) rs1800693(TNFRSF1A) rs2119704(GPR65 - KCNK10) rs2248359(CYP24A1) rs2293370(TIMMDC1) rs2300603(BATF) rs2303759(DKKL1) rs2425752(NCOA5) rs2546890(LOC285626) rs3118470(IL2RA) rs354033(ZNF767) rs4410871(MIR1204 - MIR1205) rs4648356(TTC34 - ACTRT2) rs4902647(ZFP36L1) rs650258(TRNAA45P - CD5) rs669607(EOMES - CMC1) rs7200786(CLEC16A) rs7238078(MALT1) rs7522462(C1orf106) rs7595037(PLEK - FBXO48) rs7923837(HHEX - EXOC6) rs802734(MRPS17P5 - PTPRK) rs874628(MPV17L2) rs9891119(STAT3) rs10492972(KIF1B) rs703842(CYP27B1;METTL1) rs9271366(HLA-DRB1 - HLA-DQA1) rs9657904(CBLB) rs9292777(INTS6P1 - PTGER4) rs2150702(MLANA) |
むずむず脚症候群 | rs12593813(MAP2K5) rs3104767(LOC643714) rs2300478(MEIS1) rs9357271(BTBD9) rs1975197(PTPRD) |
特発性振戦 | rs9652490(LINGO1 - DNM1P9) |
脳血管性認知症 | rs290227(SYK) |
トゥレット症候群 | rs7868992(COL27A1) |
髄膜炎 | rs1065489 |
片頭痛 | rs11172113(LRP1) rs12134493(TSPAN2 - NGF) rs2274316(MEF2D) rs2651899(PRDM16) rs4379368(C7orf10) rs6478241(ASTN2) rs6741751(TRPM8) rs9349379(PHACTR1) rs1835740(CPQ - TSPYL5) |
アトピー性皮膚炎 | rs10995251(ZNF365) rs12634229(CCDC80 - CD200R1L) rs13015714(IL1RL1 - IL18R1) rs16999165(CYP24A1 - PFDN4) rs176095(PBX2;GPSM3) rs4722404(CARD11 - RPL21P72) rs6780220(GLB1) rs878860(OR10A3 - NLRP10) |
ケロイド | rs873549(DUSP10 - QRSL1P2) rs940187 |
川崎病 | rs2254546(FAM167A - BLK) rs2857151(HLA-DQB2 - HLA-DOB) rs4813003(CD40 - CDH22) |
ハンセン病 | rs3764147(LACC1) rs6478108(TNFSF15) rs2221593 rs3762318(SLC35D1 - IL23R) rs9302752(SNX20 - NOD2) rs10414149 rs9271100(HLA-DRB1 - HLA-DQA1) rs42490(RIPK2) rs2275606(ADGB) |
尋常性白斑 | rs11966200(SLC44A4) rs2236313(RNASET2) rs1417210(SLC29A3 - CDH23) rs638893(DDX6 - SETP16) rs10876864(SUOX - IKZF4) |
喘息（ぜんそく） | rs10508372(CHCHD3P1 - HSP90AB7P) rs1701704(SUOX - IKZF4) rs1837253(SLC25A46 - TSLP) rs404860(NOTCH4) rs7686660(INPP4B - USP38) |
結核 | rs2057178(RCN1 - WT1) rs4331426(RPS4XP18 - UBE2CP2) |
COPD（慢性閉塞性肺疾患） | rs8034191(AGPHD1) |
間質性肺炎 | rs12610495(DPP9) rs1981997(MAPT) rs2034650(IVD - BAHD1) rs2076295(DSP) rs2609255(FAM13A) rs2736100(TERT) rs4727443(LOC100128334) rs6793295(LRRC34) rs7934606(MUC2) |
特発性肺線維症 | rs2736100(TERT) |
子宮内膜症 | rs10965235(CDKN2B-AS1) rs7521902(WNT4 - MIR4418) rs13394619(GREB1) rs7739264(UQCRFS1P3 - ID4) |
多嚢胞性卵巣症候群 | rs13405728(LHCGR;STON1-GTF2A1L) rs13429458(THADA) rs1894116(YAP1) rs2059807(INSR) rs2272046(HMGA2) rs2479106(DENND1A) rs3802457(C9orf3) rs4784165(C16orf97 - TOX3) rs6022786(RNU7-14P - SUMO1P1) rs705702(RAB5B;SUOX) |
非閉塞性無精子症 | rs12097821(SEPT2P1 - PRMT6) rs3129878(HLA-DRA) rs6080550(LOC100289473) |
子宮筋腫 | rs12484776(TNRC6B) rs2280543(BET1L) rs7913069(OBFC1 - SLK) |
肥満 | rs7503807(RPTOR) |
肥満1度 | rs13041126(ZFP64 - MRPS33P4) rs2531995(ADCY9) rs4735692(HNF4G - MRPL9P1) |
肥満2度 | rs17381664(ZZZ3) rs7989336(HS6ST3) |
肥満3度 | rs1421085(FTO) |
歯周病 | rs1537415(GLT6D1) |
サルコイドーシス | rs1953600(PLAC9 - ANXA11) rs479777(CCDC88B) |
デング熱 | rs3132468(MICB) rs3765524(PLCE1) |
クロイツフェルト・ヤコブ病 | rs6107516(PRNP) |
マラリア | rs8176722(ABO) rs11036238(OR51V1-HBB) |
円形脱毛症 | rs3118470(IL2RA) rs7682241(IL2 - IL21) rs9275572(MTCO3P1 - HLA-DQA2) rs9479482(RAET1M - PHBP1) |
アルコール依存症 | rs3819197(ADH1A) |
アルコールとニコチンの共依存症 | rs7445832(ISCA1P1 - HTR1A) |
限局皮膚硬化型全身性強皮症 | rs11642873(IRF8 - FENDRR) |
